Long COVID-19 syndrome associated with Omicron XBB.1.5 infection: a case report

BACKGROUND There is interest in lingering non-specific symptoms after severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection, referred to as Long coronavirus disease 2019 (Long COVID-19). It remains unknown whether the risk of Long COVID-19 is associated with pre-existing comorbidities or initial COVID-19 severity, including infections due to new Omicron lineages which predominated in 2023. OBJECTIVES The aim of this case report was to characterize the clinical features of acute XBB.1.5 infection followed by Long COVID-19. METHODS We followed a 73-year old female resident of Rio de Janeiro with laboratory-confirmed SARS-CoV-2 during acute infection and subsequent months. The SARS-CoV-2 lineage was determined by genome sequencing. FINDINGS The participant denied comorbidities and had completed a two-dose vaccination schedule followed by two booster doses eight months prior to SARS-CoV-2 infection. Primary infection by viral lineage XBB.1.5. was clinically mild, but the participant subsequently reported persistent fatigue. MAIN CONCLUSIONS This case demonstrates that Long COVID-19 may develop even after mild disease due to SARS-CoV-2 in fully vaccinated and boosted individuals without comorbidities. Continued monitoring of new SARS-CoV-2 lineages and associated clinical outcomes is warranted. Measures to prevent infection should continue to be implemented including development of new vaccines and antivirals effective against novel variants.

Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay for rapid and accurate confirmatory diagnosis of HTLV-1/2 infection

Laboratory diagnosis of human T-lymphotropic viruses (HTLV) 1 and 2 infection is performed by serological screening and further confirmation with serological or molecular assays. Thus, we developed a loop-mediated isothermal nucleic acid amplification (LAMP) assay for the detection of HTLV-1/2 in blood samples. The sensitivity and accuracy of HTLV-1/2 LAMP were defined with DNA samples from individuals infected with HTLV-1 (n = 125), HTLV-2 (n = 19), and coinfected with HIV (n = 82), and compared with real-time polymerase chain reaction (qPCR) and PCR-restriction fragment length polymorphism (RFLP). The overall accuracy of HTLV-1/2 LAMP (95% CI 74.8­85.5%) was slightly superior to qPCR (95% CI 69.5­81.1%) and similar to PCR-RFLP (95% CI 79.5­89.3%). The sensitivity of LAMP was greater for HTLV-1 (95% CI 83.2­93.4%) than for HTLV-2 (95% CI 43.2­70.8%). This was also observed in qPCR and PCR-RFLP, which was associated with the commonly lower HTLV-2 proviral load. All molecular assays tested showed better results with samples from HTLV-1/2 mono-infected individuals compared with HIV-coinfected patients, who present lower CD4 T-cell counts. In conclusion, HTLV-1/2 LAMP had similar to superior performance than PCR-based assays, and therefore may represent an attractive alternative for HTLV-1/2 diagnosis due to reduced working time and costs, and the simple infrastructure needed.

Estudo de marcadores biológicos para o desenvolvimento de paraparesia espástica tropical/mielopatia associada ao HTLV-1 (PET/MAH) em indivíduos infectados pelo vírus linfotrópico para células T humanas do tipo 1 (HTLV-1) / Study of biological markers for the development of tropical spastic paraparesis / HTLV-associated myelopathy-1 (TSP / HAM) in individuals infected with human T lymphotropic virus to cell type 1 (HTLV-1)

O vírus linfotrópico para células T humanas do tipo 1 (HTLV - 1) é um retrovírus que acarreta uma infecção persistente e, enquanto a maioria dos portadores permanece assintomática, cerca de 0,5 a 5 por cento dos indivíduos infectados desenvolve a paraparesia espástica tropical/mielopatia associada ao HTLV (PET/MAH). E ste estudo teve como objetivo avaliar parâmetros da dinâmica desta infecção, tais como a carga proviral (CPV), o padrão de integração do DNA proviral e frequência de clones infectados persistentes, a expressão dos genes virais tax e HBZ e das citocinas IFN -y e IL-10, além da frequência de células T reguladoras (Tregs), como prováveis marcadores biológicos para a identificação dos indivíduos assintomáticos (ACs) com maior chance de desenvolver PET/MAH. Em comparação com indivíduos saudáveis, ACs e pacientes com PET/MAH com CPV elevada (maior que 5 por cento) apresentaram frequências elevadas de Tregs (células T CD4 positivo FoxP3 positivo). A utilização isolada de FoxP3 na caracterização das Tregs foi adota da em virtude da expressão aumentada de CD25 por células T CD4 positivo , interferindo assim com a identificação clássica das Tregs (células T CD4 positivi CD25 positivo FoxP3 positivo). A análise de CD127 confirmou este fato, pois a frequência de células T CD4 positivo CD25 positivo CD127 negativo/low FoxP3 (negativo) se mostrou aumentada nos indivíduos infectados, e se correlacionou positivamente com a CPV...

Pacientes com PET/MAH apresentaram maior frequência de populações clonais predominantes infectadas , e estes clones foram capazes de persistir ao longo do tempo, sugerindo que contribuam para os níveis mais elevados de CPV comumente observados nestes indivíduos. A expressão dos genes virais tax e HBZ em células mononucleares foi detectada em baixos níveis, e correlacion ou de modo positivo com a CPV, send o observada diferença significativa na expressão de tax ex vivo entre ACs e mielopatas. Dessa forma, a presença de grandes populações clonais infectadas, mesmo que expressando pequenas concentrações de antígenos virais, serviria como um estímulo para a intensa resposta de linfócitos T citotóxicos . Esta hipótese foi corroborada pelos altos níveis de IFN em relação à IL-10 presentes nos pacientes com PET/MAH e em ACs com CPV alta, indica ndo que a avaliação conjunta destes parâmetros poderá melhor definir os ACs com maior risco de desenvolvimento de PET/MAH...